اداره امور منطقه آزاد کیش بر عهده سازمان است و مسئولیت های آن از سوی شورای عالی مناطق آزاد تجاری-صنعتی و ویژه اقتصادی کشور تهیه و تصویب شده است.
اهداف این سازمان مشتمل بر انجام امور زیربنایی مورد نیاز جزیره کیش-عمران و آبادانی-رشد و توسعه اقتصادی ایجاد اشتغال مفید و سازنده، جذب سرمایه گذاری داخلی و خارجی-تنظیم بازار کالا، حضور فعال در بازارهای جهانی به منظور توسعه صادرات غیر نفتی-تدارک مقدمات تولید کالاهای صنعتی و راه اندازی صنایع تبدیلی و بهره برداری از موقعیت های اختصاصی جزیره کیش می باشد.