نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاه ها حسب عنایت و دستور حضرت آیت الله خامنه ای (مدظله العالی) با هدفی متعالی و در راستای ایجاد دانشگاه مومن و متعبد به هدایت الهی و در راستای تبیین ارزش های اسلامی و تعمیق آگاهی های دینی و اعتقادی دانشجویان و دانشگاهیان و بر اساس مصوبه نهایی اسفندماه سال 1372 شورای عالی انقلاب فرهنگی مبنی بر ایجاد سازمانی جدید برای تحقق منویات معظم له، بر اساس اهداف و وظایف معین تشکیل گردید که در کلیه دانشگاه ها و مراکز آموزش عالی به انجام وظایف مصرح در اساسنامه می پردازد. نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاه ها در جهت نیل به این اهداف و وظایف الهی دو اصل مهم و اساسی را فراروی خود قرار داده است: 1ـ تاکید و تلاش جدی بر حرکت های زیربنایی و عمیق فرهنگی در راستای رشد و توسعه اندیشه ها و آگاهیهای دینی و اسلامی دانشجویان و دانشگاهیان. 2ـ ایجاد و تقویت روحیه تحرک و مشارکت فعال دانشجویان و دانشگاهیان در عرصه فعالیتهای سیاسی، اجتماعی و فرهنگی در سطح جامعه و دانشگاه ها. بر همین اساس نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاه ها با اهتمام و جدیت تمام نسبت به برنامه ریزی و ایجاد هماهنگی و ارتباط با نهادها وتشکل های دانشجویی اقدام نموده و در جهت ایجاد ارتباط با اساتید و نیروهای فرهنگی و مذهبی گام های موثری برداشته است.